Albicans Candidy
| Albicans Candidy | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Vědecká klasifikace | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Jméno dvojčlena | ||||||||||||||
| Albicans Candidy |
Mezi mnoho organismů, které žijí v lidských ústech a zažívacím traktu je kvasnice albicans Candidy, který pod životy normálních okolností v 80 procentu lidské populace s žádným škodlivým účinkem. Nicméně, přerůstání skončí kandidózou. Kandidóza je často pozorována v jednotlivcích immunocompromised takový jak HIV- pozitivní pacienti. Kandidóza také může vyskytovat se v krvi a v genitální ploše. Kandidóza je obyčejně známá jako “drozd”, a je obyčejná podmínka, která je obvykle snadno konzervovaná v lidech, kteří nejsou immunocompromised. Infikovat tkáň hostitele, obvyklá jednobuněčná kvasnice-jako forma Albicans Candidy reaguje na environmentální narážky a vypínače do útočný, vícebuněčná filamentózní forma. Toto přepínání mezi dva buňka-píše je známý jako dimorfismus.
V procesu, který povrchně se podobá dimorfismu, Albicans Candidy podstoupí proces volal “phenotypic přepínání”, ve kterém různé buněčné morphologies jsou tvořeny spontánně. Jeden z klasicky studovaných napětí to podstoupí phenotypic přepínání je WO-1, který sestává ze dvou fází - jeden to roste jako hladké bílé kolonie a jeden to je prut-jako a roste jako ploché šedé kolonie. Jiné napětí známý podstoupit přepínání 3153A; toto napětí produkuje přinejmenším sedm různé kolonie morphologies. V obou WO-1 a 3153A napíná, různé fáze konvertují spontánně k jiný (s) u nízké frekvence. Přepínání je reverzibilní a typ kolonie může být zděděn od jedné generace k jinému. Zatímco několik genů, které jsou vyjadřovalo rozdílně v různé kolonii morphologies byly poznané, některá nedávná úsilí mají focussed na čem by mohly být řídit tyto změny. Další, zda tam je potenciální molekulární spojení mezi dimorfismem a přepínání phenotypic je dráždivý problém.
V 3153A napínají, gen volal SIR2 (pro tichý informační regulátor) byl shledal, že to vypadá, že je důležitý pro přepínání phenotypic. SIR2 byl původně nalezený v Saccharomyces cerevisiae (pivovarské kvasnice), kde to je zahrnováno v chromozomální umlčovat - forma pravidla transcriptional ve kterém oblasti genomu jsou reversibly deaktivované změnami ve struktuře chromatinu (chromatin je komplex DNA a bílkoviny, které dělají chromozómy). V kvasnici, geny zapojené do kontroly nad typem spojování jsou nalezené v těchto tichých oblastech a SIR2 potlačí jejich výraz tím, že tvrdí tichý-schopný struktura chromatinu v této oblasti. Objev C. albicans SIR2 to je zapletené do phenotypic přepínání navrhne, že to příliš má tiché oblasti kontrolovaný SIR2, ve kterém phenotype-specifické geny mohou možná pobývat.
Další potenciální regulační molekula je Efg1p, faktor předpisu objevil v WO-1 napětí, které upraví dimorfismus, a více nedávno byl navrhnut pomoci regulovat phenotypic přepínání. Efg1p je vyjádřen jen v bílé a ne v šedé buňce-psát, a overexpression Efg1p v šedém ročníku způsobí rychlou změnu na bílou formu.
Doposud tam je nemnoho dat, která říkají, že dimorfismus a přepínání phenotypic používají obyčejné molekulární komponenty. Nicméně, to není nepochopitelné, že přepínání phenotypic může vyskytovat se v odezvě na nějakou změnu v životním prostředí také jako bytí spontánní událost. Jak SIR2 sám je regulován v S. cerevisiae může přesto poskytnout klíče jak k mechanismům přepínání Albicans Candidy.
Jeden z nejvíce zajímavých rysů Albicans Candidy genom je výskyt numerických a strukturálních chromozómních nových uspořádání jako prostředky ke tvoření genetická rozdílnost, jmenoval chromozóm polymorphisms délky (zkracování/expanze opakuje), reciproké translokace, vymazání chromozómu a trizómie chromozómů jednotlivce. Tyto změny karyotypic vedou ke změnám v phenotype, který je strategie adaptace této houby. Tyto mechanismy budou lépe dohodnuté s úplným rozborem Albicans Candidy genom.
Albicans Candidy genom je sequenced u Stanford DNA sekvenčního zpracování a centrum technologie. Finance pro tento projekt je poskytována národním institutem zubního a kraniofaciálního výzkumu a Burroughs-Wellcome fond. Pilot program sekvenčního zpracování je také bytí udržované Sanger centrem. Finance pro tento projekt je poskytována Beowulf Genomics.