Cladistics
Cladistics (nebo phylogenetic systematics) je odvětví biologie to určuje evoluční vztahy mezi živými věcmi založenýma na odvozené podobě. Cladistics se liší od phenetics, který seskupí organismy založené na celkové podobě, a od více tradičních přístupů založených na “charakterech klíče”. Willi Hennig je široce považovaný za zakladatele cladistics.
Založený na široké paletě informací, který zahrnuje genetickou analýzu, biochemickou analýzu a analýzu morfologie, stromy vztahu volaly “cladograms” jsou načrtnuty ukazovat různé možnosti.
Cladogram představení vztah mezi různým hmyzem seskupí používání vodorovné rovnoběžky se spojily svislými linkami. V někteří cladograms tohoto typu, délka horizontálních linek ukáže množství času, který prošel od posledního společného předku mezi dvěma skupinami nebo druhu.
Cladogram představení vztah mezi různými rostlinnými skupinami používat křížící se diagonální linky.
V cladogram, celé lži organismů u koncových bodů a každém rozkolu je ideálně binární (dvousměrný). Každá pobočka, zda to jen obsahuje jednu položku nebo sto tisíc, je nazýván clade. Správný cladogram by měl mají všechny organismy obsažené v nějakém jednom clade podílu jedinečného předchůdce pro ten clade, jeden který oni nesdílejí to s nějakými jinými organismy na diagramu. Každý clade by měl být spuštěn sérií charakteristik, které se objeví v jeho členech ale ne v jiných formách to lišilo se od. Tyto určující charakteristiky clade jsou volány synapomorphies (sdílený, odvodil charaktery). Například, tvrdil přední stranu křídla jsou synapomorphy brouků, chvíle circinate vernation, nebo se rozbalovat nových vějířovitých listů, je synapomorphy kapradin.
Typicky, analýza začne sháněním informací na jistých rysech všech organismů v pochybnost, a pak rozhodný které verze byly přítomné v jejich společném předku (plesiomorphies) a který byli odvozeni od (apomorphies). Obvykle toto je děláno tím, že zvažuje, že někteří outgroup organismy, které my známe nejsou příliš blízko příbuzné některému organismů v pochybnost. Jediné apomorphies jsou nějakého použití v charakterizovat cladistic divize.
Příští, různé možné cladograms jsou načrtnuty a ocenil. Clades je typicky natažený tak že oni mohou mít tolik synapomorphies jak možný. Nápad je že dostatečně velké množství charakteristik by mělo být velké dost přemoci nějaké příklady konvergentní evoluce. Jinými slovy, tam je mnoho cest ve kterých rostlinách a zvířatech, etc., smět vypracovat rysy, které se podobají každému jiný protože environmentálních podmínek. Známý druh konvergentní evoluce je hmyz mimicry, ve kterém některé hmyzy, které jsou jedlé přijdou k povrchně podobat se jiným hmyzům, které jsou nepoživatelné, a tak uniknout být jeden.
V praxi, neutrální rysy jako vynutit si ultrastructure (termín pro extrémně jemnou strukturu, mikroskopické nebo molekulární složení buněčné struktury) inklinovat dělat jen to, poskytovat důkaz pro skutečné vztahy dokonce když vzhled organismů dělá to jinak těžký. Když rovnocenné možnosti se objeví, jeden je obvykle volen založený na principu šetrnosti: nejvíce kompaktní uspořádání je pravděpodobné nejlepší (variace Occam holícího strojku). Jiný přístup, zvláště užitečný v molekulární evoluci, je maximální pravděpodobnost, který vybere optimální cladogram, který má nejvyšší pravděpodobnost založenou na specifickém pravděpodobnostním modelu změn.
Cladistics vyžadoval chvíli si zvyknout a tam je nějaký výslech přes v právě jaký druh cladistics okolností je vhodný. Zvláště, apomorphies nejsou vždy snadné rozlišovat a data jsou často nepřístupná přímo k řídkosti dostupných forem nebo nedostatku znalosti charakterů a tito mohou zrušit cladograms. Tam je také znepokojení že použití široce různých dat zapadne, například strukturální proti vrozeným vlastnostem, smět produkovat široce různé stromy. Nicméně, a velký cladistics se ukázal jako užitečné a soudržné rozšíření jiných metod a získal obecnou podporu.
Jako DNA sekvenční zpracování stalo se snadnější, phylogenies jsou zvýšeně často postavené s pomocí molekulárních dat. Výpočetní systematics dovolí použití těchto velkých datových souborů k cíli pojmu phylogenies. Tito mohou více přesně filtrovat opravdové synapomorphy od evoluce protějšku.
Cladistics nepřevezme nějakou zvláštní evoluční teorii, jediný zadní znalost sestupu s modifikací. Tak, cladistic metody mohou být, a nedávno byli, užitečně platil o non-biologické systémy, včetně určovat jazykové rodiny ve diachronické jazykovědě a filiation rukopisů v textové kritice. Cladistic klasifikace
Nedávný trend v biologii od šedesátých lét, volal cladism nebo cladistic taxonomii, je potřebovat taxa (pojmenované skupiny v taxonomii) být clades. Jinými slovy, cladists argumentují systém klasifikace by měl být reformovaný odklidit všechny non-clades (paraphyletic a skupiny polyphyletic). Ve skutečnosti, některé cladists zastávaly se úplně opouštět Linnaean systém zařazeného taxa ve prospěch clades. Formální kód názvosloví phylogenetic, Phylocode[1], je současně ve vývoji pro taxonomii cladistic, která opouští Linnaean strukturu.
Opravdový clade je považován za monophyletic, nebo obsahovat jednoho (a jediný) dokončit evoluční seskupení pocházet z jednoho společného předku. Když pojmenovaná skupina se nalézá obsahovat víc než jedna evoluční linka, to je nazývané polyphyletic. Například, jakmile-rozpoznal skupinu Pachydermata se nalézal být polyphyletic protože slon a nosorožec byli každý shledal být více silně k non-tlustokožci než jeden ke každému jiný. Biologové zvažují skupiny, které dopadají být polyphyletic být chyby v klasifikaci, často nastávat protože sbližování nebo jiné homoplasy byli překrouceni jako homology.
Jestliže pojmenovaná skupina se nalézá zahrnovat některé ale ne všichni potomků předka na kterém skupina je umístěná, to je nazývané paraphyletic. Paraphyletic skupiny jsou obvykle vytvořeny, když organismy jsou skupiny na východisku pro plesiomorphies místo toho apomorphies. Klasické příklady paraphyly obsahují Pisces (rybaří), jehož potomci zahrnují tetrapods (obojživelníci, plazi, ptáci, a savci), a Reptilia, jehož potomci zahrnují ptáky; nicméně, ani tetrapods ani ptáci jsou zahrnuti ve skupinách jmenoval Pisces a Reptilia, příslušně. Většina skupin paraphyletics, nicméně, byl postaven u úrovně rodu, protože kovové peníze byly seskupeny na celkové podobě předchozí k analýze cladistic.
Popření uznání ke skupinám paraphyletic bylo velmi kontroverzní v biologii a pozůstatkách tak mezi množství tradičnějších evolučních taxonomists. Oni cítí, že odpuštění od paraphyly vede ke ztrátě informací v systému klasifikace o závažných změnách v morfologii organismů, ekologie nebo historie života. Společně, oni argumentují, že ponětí o clade a taxon by měla být zůstal zřetelný, a že paraphyletic taxa jsou nutné jestliže každá skupina bude být rozebrána úplně do podskupin. Ve skutečnosti, evoluční taxomonists takový jak Peter Ashlock zahrnuje paraphyly pod termínem monophyletic, rezervovat termín holophyletic pro úzký význam monophyletic.
Cladists namítá, že “závažné změny” rozpoznaly evolučním taxonomists být často příliš subjektivní být východisko pro klasifikaci.
Viz též vědecká klasifikace, strom života, phylogenetic strom, systematics, taxonomie, Willi Hennig